No software Intel® Quartus® Prime Pro Edition versão 21.1 e anterior, há um problema com o controlador Agilex SDM QSPI sendo desativado para o HPS após a configuração inicial de FPGA ocorrer durante o primeiro modo de inicialização do HPS. Isso ocorre após a primeira FPGA configuração de U-Boot e/ou Linux.
Para resolver este problema, você pode re-sondar o driver flash QSPI após a configuração inicial FPGA configuração.
Para re-sondar em U-Boot execute este commmand:
SOCFPGA_AGILEX # sf probe
Este problema está programado para ser corrigido em uma futura versão do software Intel® Quartus® Prime Pro Edition.